Біолого-технологічний факультет Білоцерківського національного аграрного університету має багату історію, яка почалася з 1920 року започаткуванням зоотехнічного кабінету. А вже з 1932 року почав свою роботу зоотехнічний факультет на якому у період з 1933-1934 рр. були сформовані кафедри спеціальної і загальної зоотехнії, розведення, годівлі сільськогосподарських тварин. Організатором і першим деканом зооінженерного факультету протягом 1932-1938 рр. був доцент Й.І. Хоцянівський – висококваліфікований фахівець, справжній знавець своєї справи. За короткий час він зумів укомплектувати провідні кафедри факультету професійними кадрами. У довоєнний період на кафедрах зоотехнічного факультету працювали відомі вчені в галузі тваринництва. Саме вони визначали обличчя факультету – якість підготовки зоотехнічних кадрів. Проте, в 1937 р. зоотехнічний факультет був об'єднаний із ветеринарним для підготовки єдиних фахівців тваринництва – ветеринарних лікарів широкого профілю. У повоєнний час зоотехнічний факультет провів набір на І курс лише в 1949 р. Першим деканом відновленого зоофаку був доцент І.Г. Батуревич, який працював на цій посаді до 1952 року. Чимало зусиль і енергії він віддав створенню нового факультету. Тривалий час (1961–1968 рр.) поєднував роботу завідувача кафедри зоогігієни і основ ветеринарії з роботою декана зоотехнічного факультету доцент М.Ф. Гудков. За цей період усі кафедри факультету, включаючи загальноосвітні, були повністю укомплектовані кадрами.

З 1968-го до 1972 рр. деканом факультету працював завідувач кафедри розведення і генетики професор В.Н. Фесик, який також чимало зробив для зміцнення матеріально-технічної бази факультету, вдосконалення навчального процесу, підготовки науково-педагогічних кадрів в аспірантурі. З 1972-го до 1976 рр. деканом факультету був завідувач кафедр органічної і біологічної хімії, заслужений працівник вищої школи України, професор О.І. Кононський.

Для розвитку факультету багато зробив доцент кафедри крупного тваринництва В.П. Федоров, який працював деканом майже 13 років (1976–1989 рр.). Вдосконалювалися навчальні плани, змінювалася матеріальна база, розширювалися зв'язки факультету із сільськогосподарськими підприємствами та науковими установами. З березня 1989-го до жовтня 1991 рр. деканом факультету працював завідувач кафедри дрібного тваринництва, професор В.І. Бесулін; з 1991 до 2003 рр. факультет очолював доцент М.С. Ківа. Під його керівництвом факультет поступово вийшов за рейтингом серед 14 навчальних закладів цього профілю на перше місце. У квітні 2003 року виконувати обов’язки декана призначили доцента кафедри технології кормів та годівлі сільськогосподарських тварин Бомка Віталія Семеновича. Сучасна назва факультету була затверджена у квітні 2004 року.

За активної участі декана В.С. Бомка біолого-технологічний факультет із 2004/2005 навчального року перейшов на підготовку якісно нових фахівців тваринництва за напрямом 1302 – зооінженерія за спеціальністю “технологія виробництва і переробки продукції тваринництва”, освітньо-кваліфікаційних рівнів: 6.130200 – бакалавр, 7.130201 – спеціаліст, 8.130201 – магістр, із присвоєнням відповідних кваліфікацій: технолог – ОКР “бакалавр”, інженер технолог – ОКР “спеціаліст”, технолог-дослідник – ОКР “магістр”.

У 2017 році на посаду декана було обрано доктора с.-г. наук, професора Мерзлова С.В. За його каденції до 2021 року було створено нові кафедри, відкрито нову освітню програму зі спеціальності 162 «Біотехнології та біоінженерія».

З 2021 року біолого-технологічний факультет очолив кандидат сільськогосподарських наук, доцент Чернюк Сергій Васильович, який був обраний на посаду декана за конкурсом. З моменту свого призначення він приділяв особливу увагу удосконаленню освітнього процесу, модернізації навчальних програм, активізації науково-дослідної діяльності студентів і викладачів, а також розвитку матеріально-технічної бази факультету.

Події 2022 року, пов’язані з повномасштабним вторгненням російських військ на територію України, суттєво вплинули на діяльність факультету. У цей складний період основні зусилля керівництва та колективу були спрямовані на збереження єдності факультету, підтримку студентів і викладачів, а також на пристосування освітнього процесу до умов воєнного часу. Незважаючи на складні обставини, факультет продовжив роботу, зберігши високу якість навчання та наукової діяльності.

Під керівництвом С.В. Чернюка факультет поступово адаптувався до нових викликів, впроваджуючи дистанційні форми навчання, підтримуючи волонтерські ініціативи та сприяючи участі студентів і викладачів у проєктах, спрямованих на відновлення і розвиток аграрної освіти України.

З 2024 року на посаду декана обрано кандидата с.-г. наук, доцента Ластовську І.О. яка впроваджувала основні принципи освітньої діяльності, зокрема: партнерства, студентоцентризму, професіоналізму та компетентності працівників, прозорості та логічності процесів прийняття рішень, корпоративної культури, здоров'я та безпеки.

Для підвищення результативності організаційно-адміністративної роботи продовжила впровадження електронного документообігу на факультеті.

З 2025 року було обрано деканом доктора с.-г. наук, професора Мерзлова С.В. 

Біолого-технологічний факультет – колектив однодумців, об’єднаних спільним прагненням підготувати конкурентоспроможних фахівців, підготовка яких проводиться за трьома спеціальностями Н2 – «Тваринництво», G13 – «Харчові технології» та G 21 «Біотехнології та біоінженерія». Колектив налічує 1102 особу, у тому числі 1008 студентів, 67 науково-педагогічних працівників, 20 аспірантів, 7 лаборантів. У структурі факультету функціонують 8 кафедр, 3 науково-дослідних лабораторії, науково-навчальна лабораторія та науково-дослідний інститут тваринництва та харчових технологій. 

На факультеті створена достатня матеріально-технічна, навчально-методична і соціальна бази для нормального функціонування навчального процесу. 

У корпусі № 9 до послуг студентів працює читальна зала на 30 посадкових місця і бібліотека з фондом 110000 книг. Рівень забезпеченості студентів підручниками і навчальними посібниками становить 100 %. Важливою складовою наукової роботи є участь студентів у проведенні досліджень. На факультеті працює 11 наукових студентських гуртків, в яких займається дослідною роботою близько 300 студентів. Кращі роботи гуртківців щорічно заслуховуються на студентських наукових конференціях нашого університету і споріднених вищих навчальних закладів.

Факультет активно розвивається й сьогодні, готуючи студентів до роботи в умовах сучасного ринку. Серед ключових напрямків діяльності – навчання з використанням інноваційних лабораторій, впровадження цифрових технологій у дослідженнях та співпраця з міжнародними університетами й науковими установами. Практика на провідних агропромислових підприємствах України, що дозволяє їм здобувати практичний досвід уже під час навчання, проводить активну наукову діяльність, досліджуючи генетичні ресурси тварин, розробляючи екологічно чисті методи годівлі та створюючи інноваційні технології в тваринництві. Біолого-технологічний факультет сьогодні є місцем, де поєднуються традиції і сучасність, створюючи платформу для підготовки нових поколінь фахівців, готових працювати задля сталого розвитку аграрного сектору.